Архив номеров журнала "Кардиология"

2012 ·· 2011 ·· 2010 ·· 2009 ·· 2008 ·· 2007

Журнал "Кардиология" №9, 2008

Анализ экспрессии генов в миокарде ушка правого предсердия у пациентов с фибрилляцией предсердий методом кДНК транскрипционных матриц

Методом транскрипционных матриц исследован уровень экспрессии 2900 генов у пациентов с фибрилляцией предсердий (ФП) или синусовым ритмом сердца. Генные транскрипты были анализированы в ткани ушек правого предсердия 47 пациентов, которым выполнено хирургическое вмешательство — протезирование митрального клапана или аортокоронарное шунтирование. Для исследования активности дифференциально экспрессирующихся генов в группах пациентов с разными клиническими признаками были использованы стандартный корреляционный анализ и метод двумерного иерархического кластерирования. Выявлена высокая положительная корреляция экспрессии генов, кодирующих ЛИМ-доменный белок сердечной мышцы (CSRP3), тяжелую b-цепь миозина (MYH7), кальмодулин (CALM3) и гомеодоменсодержащий белок (PKNOX1) с ФП (r>0,77, p<0,007). Напротив, гены, кодирующие металлотионеин (MT1/2), митохондриальную альдегиддегидрогеназу 2-го типа (ALDH2), гуаниннуклеотидсвязывающий белок (GNAL) и ras-подобный белок (Rap1A), проявили отрицательную корреляцию экспрессии с ФП (r<-0,75, p<0,002). Изменения в активности генов при постоянной форме ФП были более выражены, чем при пароксизмальной. Кроме того, гены, экспрессия которых повышалась при ФП, проявляли пониженную экспрессию при ишемической болезни сердца (r=-0,80, p=0,0002) и наоборот. Коррелирующие с ФП гены принадлежат к разным функциональным категориям, включая организацию сократительного аппарата кардиомиоцита, кальциевый гомеостаз, регуляцию транскрипции и передачи сигнала, межклеточные взаимодействия и окислительный стресс. Снижение экспрессии генов MT1/2 и ALDH2, известных протекторов окислительного стресса, возможно, вносит свой вклад в поддержание состояния окислительного стресса в миокардиальных тканях у пациентов с ФП. Идентификация новых генов — участников патологических событий при ФП может открыть новые перспективы для поиска средств терапии этого заболевания.

Ключевые слова: фибрилляция предсердий, экспрессия генов, кДНК-транскрипционные матрицы.

Gene Expression Analysis in Myocytes of Right Atrial Appendages in Patients With Atrial Fibrillation Using cDNA Microarray Technique

Gene expression level of 2900 genes was studied by cDNA microarray in patients with atrial fibril-lation (AF) or sinus rhythm. Gene transcripts were analysed in samples of right atrial appendages from 47 patients undergoing surgery for valve repair or coronary artery bypass. Standard correlation analysis and two dimensional hierarchical clustering were used for study of differentially expressed genes in patient groups. A highly positive correlation of gene expression with AF was shown for cardiac muscle LIM domain protein (CSRP3), cardiac muscle myosin heavy chain beta isoform (MYH7), calmodulin (CALMS) and homeobox protein (PKNOXl) genes (r>0.77, p<0.007). In contrast, metallothionein (MT1/2), mitochondrial aldehyde dehydrogenase 2 (ALDH2), ras-related protein (RaplA) and guanine nucleotide binding protein G (GNAL) genes revealed highly negative correlation with AF (r<-0.75, p<0.002). Alterations of gene activity were more evident at permanent as compared with paroxysmal AF. In addition, genes overexpressed in AF patients demonstrated underexpression in coronary artery disease patients (r=-0.8, p=0.0002) and conversely. Genes correlating with AF belong to different functional categories, including sarcomere organization, contraction, Ca2+ homeostasis, signaling and transcription regulation, extracellular matrix interactions and oxidative stress. Downregulation of MT1/2 and ALDH2 genes, known protectors against oxidative stress, may contribute to maintenance of oxidative stress in myocardial tissues of AF patients. The identification of novel genes — participants of pathological process in AF may open new perspective for search of therapeutic agents.

Key words: atrial fibrillation, gene expression, cDNA microarrays.

Вернуться к оглавлению номера №9